在 Imaris 内创建分析流程方案:用户如今可直接在 Imaris Surpass 中创建完整的图像分析方案。
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Imaris 11 推出了全新的图像分析方式 —— “工作流” 功能。这是一套分步式系统性解决方案,旨在简化分析流程、提升操作效率,同时支持批量处理与方案共享。本次更新聚焦提升新老用户的使用体验,进一步强化自动化、结果可重复性与协作功能。
在 Imaris 内创建分析流程方案:用户如今可直接在 Imaris Surpass 中创建完整的图像分析方案。
可批量的工作流:工作流程支持自动化处理,包括手动步骤,使其具备高度灵活性。
工作流程的导出与导入:可跨用户或数据集共享分析工作流,以促进协作与结果可重复性。
简单易上手:预定义工作流程让新用户更易上手开展分析。
用户可通过自动或手动创建的 Surfaces定义感兴趣区域,精准检测特定感兴趣区域内Spots、Filaments、Cells及其他结构。该功能通过将检测范围限定在特定区域来实现针对性分析,从而提升准确性与效率。
常使用 Imaris 的 Spots 或 Surfaces使用Mask功能创建感兴趣的通道(即删除外部的信号,或删除内部的信号)。从 Imaris 11.0版本开始,该功能已完全集成到工作流和批量处理中(图像编辑选项),允许用户在多个数据集中自动执行带Mask的通道创建操作。
优势:
新引入了一款机器学习,以增强Spots和Surfaces的检测与分类。该功能允许用户借助基于机器学习的高级筛选方法,提高对象识别和分割的准确性。
现支持仅导出选定的统计数据值,并以表格形式呈现。这使得下游数据分析更加高效。这种针对性导出功能简化了外部统计工具的数据处理流程,助力Imaris用户实现高效科研。
工作流现在支持在批量处理中嵌入手动步骤,实现自动化与手动精准调整的完美结合。例如:
Imaris 11.0 引入了使用快照在数据集中保存多个"视图"的功能。通过这种方式,研究人员能够在单个数据集中永久保存多个关键视角。该版本还支持为单个数据集创建多个关键帧动画,从而节省重建视觉故事的时间。
Imaris Cell 现在支持将预先创建的对象作为已定义工作流的一部分进行自动导入。此操作完全支持批量处理,可简化重复性任务的分析流程。
一维和二维Vantage图表全新升级比较分析选项,支持用户跨实验组、跨数据集对比分析结果。为挖掘数据趋势、识别数据差异提供强大工具,助力科研决策更高效。
Imaris 11 恢复了 9.9 版本中的树突脊直径计算方法,该方法与 10.0版本的方法一起,为用户提供了两种自动拟合分析的选项。这一功能带来了灵活性,使用户能够选择最适合其数据和分析需求的方法。
Imaris 11 精心打造清晰易用且支持批处理的工作流,助力用户大幅提升研究的再现性、协作顺畅度与分析效率。无论您是刚入门的新手用户,还是经验丰富的资深从业者,本次版本升级所搭载的实用工具,都能助力您的图像分析工作迈上新台阶。
自 Imaris 10.2 版本以来已修复的 35 个漏洞清单:
| Bug Number | Bug Description |
| 11763 | Summary tab in Vantage for Objects View should also be available when box plots are not switched on |
| 13282 | Enable batch import surfaces/spots to a Cell object |
| 13359 | Imaris files can not be loaded into Imaris Stitcher hangs at 95% - no error message |
| 13407 | Batch function can't treat subfolder dataset on v9.9 (991,990) |
| 13521 | Manually added seed points are not visualized in the classification step |
| 13559 | Spine diameter calculation in the FilamentTracer wizard does not yield good results |
| 13560 | Importing 3D TIFF segmentation as a Time lapse |
| 13664 | Label Colors are not saved in batch processing parameters, each image has it own Label color palette |
| 13739 | Manipulator can not be selected in Batch Pipeline Editor with ML segmentation |
| 13781 | Control Contour Line Color for 2D Images |
| 13801 | Export of Statistics very slow when multiple datasets are included |
| 13810 | Camera view setting to Orthogonal is not saved in the IMS file in Imaris 10.1.1 |
| 13831 | Track ID Color for Filament Does Not Work |
| 13835 | Error 'Could not load scene. out of memory' when loading specific datasets with ML generated Surfaces |
| 13843 | For Surfaces imported into Cells the Area is 0 for 2D dataset |
| 13873 | Using Creation Parameters with ML Pixel Classification does not work if a ROI was used during training |
| 13880 | Files containing many characters in the naming and who have multiple batch results, show Error message upon exporting All statistics |
| 13881 | Spots and tracks created by Batch have visualization issues |
| 13882 | Pixel classification seed points falling outside of the ROI when you have multiple ROIs |
| 13882 | Surface creation in timelapse using ROIs and pixel classification are broken |
| 13908 | Reference Frame drift correction not considered for tracking |
| 13936 | Label images are not correctly imported |
| 13938 | Surface Visualization artifacts in 3D at low zoom and during rotation |
| 13949 | Distance Transform is creating an inccorrect channel mask on surfaces in 2D image |
| 13950 | FileConverter can not convert files if the absolute filepath is too long |
| 13960 | CSV versus XLS Statistic output does not match |
| 13974 | Statistics export between Surpass and Vantage do not match exactly in Imaris 10.2 |
| 13975 | Private Wi-Fi Address function of macOS 10.1 Sequoia blocks license creation and usage |
| 13982 | Seed point diameter is significantly affects surface splitting with Pixel classification segmentation (morphological spilt) |
| 13984 | Channel shift changes voxel size to 1 x 1 x1 in Imaris 10.2 |
| 13987 | No units displayed for some Surfaces - Overlapped Volume to Surfaces=Surfaces |
| 13988 | Time is not Exported on Untracked Batch Data Sets |
| 13989 | Statistics bar backwards for object statistics display |
| 13990 | Imaris 10.2 fatal crash using filaments in timelapse images - editing track tree |
公安机关备案号31010402003473